El respeto al medio ambiente constituye una de las líneas de acción estratégica del Puerto de Santander, lo que se ha traducido en una política medioambiental enfocada al concepto de "desarrollo sostenible". En este sentido, la Autoridad Portuaria ha considerado prioritario la colaboración con otras Instituciones, como se puso de manifiesto cuando se llevó a cabo las obras del saneamiento integral de la Bahía, proyecto que discurría en buena parte por la zona de servicio portuaria, y al que se dieron todas las facilidades y apoyo.

La limpieza de la Dársena de Molnedo es una iniciativa que profundiza en la labor anteriormente expuesta, dado que mejora el medio ambiente de esta infraestructura portuaria, beneficiando así, tanto a los clubes deportivos o a las diferentes entidades que hacen uso habitualmente de los atraques, como Prácticos del Puerto, Amarradores, Centro Oceanográfico, así como a la ciudadanía en general, dado que afecta directamente a un elemento, "Puertochico", integrado de lleno en el tejido y el paisaje urbano santanderino.

De esta manera, aprovechando las últimas mareas vivas en la Bahía, en concreto durante los días 14, 15 y 16 de mayo, que llegaron a un coeficiente de 106, la Autoridad Portuaria llevó a cabo la limpieza minuciosa en la Dársena de Molnedo, principalmente en la zona de las rampas de la zona este. Las más de tres toneladas de basura extraídas proceden, en su mayor parte, de objetos abandonados en las rampas.